Diversos estudios han demostrado que los arrecifes artificiales favorecen al cabo de unos pocos años la recuperación de la zona dañada y de la pesca artesanal y sostenible. Según la organización Oceana, algunas investigaciones han señalado cifras de volúmenes de fauna hasta 35 veces superior a las encontradas en fondos circundantes. Un estudio sobre pecios a diferentes profundidades en el Golfo de México demostró que especies amenazadas como los corales de profundidad de los géneros Lophelia y Oculina colonizaban estas estructuras. Los responsables del Ministerio de Medio Ambiente y Medio Rural y Marino (MARM) aseguran que los arrecifes artificiales reducen la mortalidad de las fases juveniles antes de su reproducción, facilitan fuentes de alimentación para determinadas especies y posibilitan la supervivencia de adultos reproductores en zonas nuevas y la mejora en la gestión de los usos de estos recursos. Más de 40 países de todo el mundo, como Estados unidos, Canadá, Japón, Australia, Nueva Zelanda, Francia o España, utilizan desde hace décadas estos arrecifes artificiales con fines de protección y restauración de los fondos submarinos. Diversas empresas y organizaciones se han especializado en la promoción, instalación y posterior seguimiento de estas estructuras. En Japón, se comercializan más de cien modelos diferentes, denominados "Tsukiiso".

Arrecifes artificiales en España
Los arrecifes artificiales en España se comenzaron a usar a principios de los años ochenta. En la actualidad, se contabilizan 130 repartidos por toda la costa peninsular e insular, que pueden verse en la base de datos del MARM. Cataluña cuenta con los primeros, a partir del proyecto "Escorpora", en 1981 y Sa Riera-Begur, en 1982. Durante esa década, se colocaron una decena de nuevos arrecifes artificiales en Cataluña, Valencia, Canarias, Baleares y Andalucía. Pero es en los años noventa cuando despega el uso de estos arrecifes como medida de gestión pesquera, al instalarse 93. Los responsables instituciones contemplan estos sistemas como una medida de preservación directa de los hábitats de interés pesquero y de regeneración de los recursos. Por ello, se han decantado por el uso de arrecifes artificiales de protección, para disuadir a los buques arrastreros de sus prácticas ilegales. Este tipo de estructuras ocupan zonas superiores a la decena de km2. Los módulos se distribuyen de forma discontinua en barreras y se dejan entre sí áreas libres que permiten las actividades pesqueras no destructivas. Las autoridades fijan una zona protegida alrededor del arrecife y, en algunas ocasiones, pueden prohibir la pesca.
Los responsables de estos arrecifes utilizan sistemas de navegación y posicionamiento por satélite GPS para localizar de forma correcta su ubicación y su posterior seguimiento. Una vez instalados, se realizan estudios durante al menos cinco años para comprobar los resultados. Los investigadores utilizan diversos sistemas, como aparatos de sonar, mapas digitalizados del relieve del fondo marino, encuestas al sector pesquero o capturas experimentales.

Detractores
Algunos de estos arrecifes artificiales han recibido críticas por sus efectos negativos. En ciertos casos, se han utilizado neumáticos usados o pecios que contenían diversas sustancias tóxicas. En otros casos, se han ubicado en lugares sin el debido estudio de impacto ambiental o no se ha realizado un seguimiento posterior de sus efectos a lo largo del tiempo. Según Oceana, en los últimos años se han mejorado los parámetros ambientales, como la eliminación de compuestos tóxicos o zonas que tenían un potencial de contaminación del medio, así como el estudio del lugar o la utilidad que podía ofrecer.